任何手術都有可能產生術後的併發症，減重手術也一樣，減重手術可能會發生多種併發症。手術的風險取決於病人接受的是哪一種類型的手術，以及病人本身是否有合併身體的其他疾病。一些較常見的早期手術併發症，大約手術後一到六週發生，包括：
一、出血
二、感染
三、腸道阻塞或滲漏
四、脫水，噁心，嘔吐
還有一些手術後較嚴重的併發症包含：肺栓塞和深部靜脈栓塞，肺栓塞會造成呼吸困難，腿部深部靜脈會造成腳腫脹發黑。還有心肌梗塞，肺炎，尿道感染等等。儘管術後還是有可能造成死亡，包含胃水球手術，不過機率非常的低。
在任何情況下都可能發生手術併發症。如果可以，最好在有豐富手術經驗的減重中心進行，才能減低手術的併發症。通常，健全的減重中心具有：
一、具有認證資格，有經特殊訓練，並且有大量減重手術案例的外科醫師。
二、對減重具有豐富照護經驗的醫護人員。包括手術時提供麻醉的麻醉科醫師，以及能照護減重手術病人的護理師。
三、具有完整的團隊，出院後能支持病人術後的生活，包含營養師，心理諮詢師，護理師，輔導員。
四、具有可靠的諮詢管道，能在所有時間（包括下班後和假日）給病人協助。
五、手術後能長期追蹤病人的狀況。
減重手術後，日常生活該注意什麼
手術後病人通常要住院一到三天，視病情而定，有時時間要更長，直到醫師認為可以出院為止。如果有服用止痛藥，請勿開車，因為有些止痛藥會影響神經系統。手術復原後，應盡快開始運動課程，而大多數減重中心也會幫助病人設計運動計劃。
回到家後，務必嚴格按照醫師和營養師的飲食建議。而且也要定期回診，以監控健康，飲食和體重的狀況。隨著時間，可以慢慢增加飲食量，不過以下的情況要注意：
一、不斷地重新評估食物攝取量，確保有健康的習慣，因為體重隨時都可能會再增加。
二、選擇健康食品，不要禁食或催吐。
三、慢慢的，完全的咀嚼食物。
四、專注吃飯，避免分心，例如看電視。
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消化系統的健康教室